गोरखपुर रेलवे स्टेशन के यार्ड री-मॉडलिंग और गोरखपुर कैंट से कुसुम्ही रेलवे स्टेशन के बीच तीसरी लाइन की कमीशनिंग की वजह से कई ट्रेने 11 और 12 सितम्बर को निरस्त रहेंगी, जबकि कई रेलगाड़ियों के मार्ग में बदलाव किया गया है। निरस्त की गई ट्रेनों में बरौनी-लखनऊ एक्सप्रेस, लखनऊ-पाटिलीपुत्र, लोहित एक्सप्रेस, छपरा-मथुरा एक्सप्रेस, गोमतीनगर-कामाख्या एक्सप्रेस सहित कई रेलगाड़ियॉ शामिल है। वहीं वाराणसी कैंट में यार्ड रिमॉडिलिंग के चलते साबरमती एक्सप्रेस 11 सितम्बर से 15 अक्टूबर तक बदले हुए मार्ग से चलेंगी। अहमदाबाद-वाराणसी एक्सप्रेस बदले हुए मार्ग वाया अयोध्या, मनिकापुर, गोरखपुर, भटनी, मऊ और औड़िहार होकर वाराणसी जायेंगी।